在大多數的測量問題，與熱電偶的使用錯誤是由于缺乏熱電偶如何工作的理解。下面列出的是一些比較常見的問題和隱患做到心中有數。
連接問題。許多測量誤差所造成的意外熱電偶路口。請記住，任何會導致兩種不同的金屬交界的路口。如果你需要增加你的熱電偶導線的長度，你必須使用正確類型的熱電偶延長線（如K型熱電偶K型）。使用任何其他類型的線，將引入一個熱電偶的交界處。使用任何連接器必須作出正確的熱電偶材料，必須遵守和正確的極性。
引線電阻。為了盡量減少熱分流和提高響應時間，熱電偶是由薄的金屬絲（鉑類型的情況下，成本也是一個考慮）。這可能會導致熱電偶具有較高的電阻，它可以使噪聲敏感，也可能導致錯誤，由于測量儀器的輸入阻抗。一個典型的暴露32 AWG導線（0.25毫米直徑的）交界處的熱電偶，將有一個約15歐姆/米的電阻。的Pico TC - 08 2MΩ輸入阻抗，因此會產生這種電纜12米的誤差小于0.01％。如果需要用細導線或長電纜熱電偶，它是值得保留的熱電偶引線短，然后用熱電偶延長線（這是厚得多，因此具有較低的電阻），熱電偶和測量儀器之間的運行。它始終是一個很好的預防措施，以你的熱電偶的電阻測量使用前。
         通常的原因是大氣顆粒物擴散到金屬在工作溫度。另一個原因是雜質和化學品擴散到熱電偶導線絕緣。如果在高溫下操作，檢查探頭絕緣層的規范。
噪音。從熱電偶的輸出是一個小的信號，所以，很容易產生電氣噪聲拿起。大多數測量儀器拒絕任何共模噪聲信號是相同的兩條電線，這樣噪音可以通過電纜扭在一起，以幫助確保兩條電線拿起相同的噪聲信號的zui小化。如果工作在一個非常嘈雜的環境中（如大型電機附近），這是值得考慮使用屏蔽的延長線。如果懷疑噪聲拾取先關掉所有可疑設備，看看如果讀數的變化。
共模電壓。雖然熱電偶信號非常小，往往存在著更大的電壓測量儀器的輸入。這些電壓可能會造成電感拿起（一個問題，當測試電機繞組和變壓器的溫度），或“接地”的路口。一個典型的例子是“接地”的交界處測量溫度的熱水管與非絕緣的熱電偶。如果有任何不良的接地連接幾伏之間可能存在的管道和大地測量儀器。這些信號再普通模式（在這兩個熱電偶導線相同），因此不會造成大多數儀器的問題提供他們不會太大。使用相同的電纜噪聲概述的預防措施，可以減少共模電壓，也可以通過使用絕緣熱電偶。
熱分流。所有熱電偶有一定的質量。供熱質量，需要的能量，從而會影響你試圖測量溫度。考慮在試管中的液體溫度測量的例子：有兩個潛在的問題。*是熱能將前往熱電偶導線和消散到大氣中，從而減少導線周圍的液體的溫度。類似的問題可能發生，如果沒有充分沉浸在液體中，由于較冷的環境電線上的空氣溫度熱電偶，熱傳導，可能會導致熱電偶的交界處，以不同的溫度，液體本身。在與更薄的導線熱電偶可能會有幫助，因為它會導致一個陡峭的溫度梯度沿液體和周圍空氣之間的交界處的熱電偶導線。如果使用細導線的熱電偶，必須考慮支付引線電阻。熱電偶用細導線連接到更厚的熱電偶延長線的使用，往往提供了的折衷辦法。